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流行性出血熱病毒RNA原位雜交檢測技術建立與應用研究

更新時間:2025-03-21      點擊次數:182

摘要

通過優化探針設計、雜交條件及信號檢測體系,成功建立了流行性出血熱病毒(EHFV)RNA原位雜交檢測技術。實驗采用威尼德原位雜交儀完成靶標RNA的高效雜交,結合某試劑實現靈敏信號擴增。臨床樣本驗證表明,該方法特異性強、靈敏度高,可精準定位病毒RNA在組織中的分布,為EHFV感染的病理機制研究及臨床診斷提供了可靠工具。

引言

流行性出血熱(EHF)是由漢坦病毒引起的急性傳染病,其高致死率及復雜病理機制對精準診斷技術提出了迫切需求。目前,血清學檢測和RT-PCR技術雖廣泛應用,但存在無法定位病毒RNA原位分布、易受交叉反應干擾等局限。RNA原位雜交技術(RNA-ISH)通過特異性探針與靶標RNA結合,可在組織切片中實現病毒核酸的時空可視化,為研究病毒侵染路徑及宿主應答提供關鍵信息。

然而,傳統RNA-ISH技術面臨探針穿透性差、背景信號高、操作流程繁瑣等問題。本研究針對EHFV基因組保守區設計高特異性探針,優化雜交緩沖體系與信號擴增方案,結合威尼德分子雜交儀的高精度溫控功能,建立了穩定、高效的EHFV RNA原位檢測體系,并系統評估其臨床應用價值。

實驗部分

1. 材料與儀器

樣本來源:收集EHFV感染患者肝、腎、肺組織樣本(經倫理委員會批準),以及健康人組織作為陰性對照。

主要儀器:威尼德電穿孔儀(用于探針標記)、威尼德紫外交聯儀(樣本固定)、威尼德原位雜交儀(雜交反應)、熒光顯微鏡及圖像分析系統。

試劑:某試劑RNA探針標記試劑盒、某試劑蛋白酶K、某試劑封閉液、某試劑熒光標記鏈霉親和素。

2. 實驗方法

2.1 探針設計與標記
針對EHFV S基因保守區(GenBank登錄號:NC_005218.1)設計5條長度為500-800 bp的反義RNA探針,通過威尼德電穿孔儀將digaoxin標記的dUTP摻入探針。探針純度經瓊脂糖凝膠電泳驗證,濃度調整為20 ng/μL備用。

2.2 組織預處理

固定與切片:組織樣本經4%多聚甲醛固定24 h,石蠟包埋后切片(厚度4 μm),60℃烘片2 h。

去石蠟與通透化:依次用二甲苯、梯度乙醇脫蠟,某試劑蛋白酶K(10 μg/mL,37℃)處理15 min,威尼德紫外交聯儀(UV 254 nm,能量300 mJ/cm2)交聯5 min以增強探針結合效率。

2.3 原位雜交反應

預雜交:切片浸入預雜交液(含50%甲酰胺、5×SSC、1%阻斷劑),42℃孵育1 h。

雜交:加入探針(終濃度2 ng/μL),置于威尼德原位雜交儀中,42℃反應16 h。

洗脫:依次用2×SSC(含0.1% SDS)、0.5×SSC(含0.1% SDS)及0.1×SSC嚴格洗脫非特異性結合。

2.4 信號檢測與成像

免疫顯色:滴加某試劑抗digaoxin抗體(1:500稀釋),37℃孵育1 h,PBS洗滌后加入某試劑NBT/BCIP底物,避光顯色10 min。

熒光檢測:若采用熒光標記,使用某試劑Cy3標記鏈霉親和素(1:1000)孵育,封片后通過熒光顯微鏡采集圖像,ImageJ軟件定量分析信號強度。

2.5 特異性與靈敏度驗證

特異性:以健康組織及登革病毒(DENV)感染樣本為對照,評估交叉反應。

靈敏度:梯度稀釋EHFV RNA標準品(10^6~10^1 copies/μL),確定檢測下限。

結果與分析

1. 探針效率驗證
凝膠電泳顯示探針條帶清晰,標記效率≥85%。陰性對照(無探針或正義鏈探針)未檢測到顯色信號,表明探針特異性良好。

2. 檢測靈敏度
熒光法檢測下限為10^2 copies/μL,顯色法為10^3 copies/μL,顯著優于常規RT-PCR(10^4 copies/μL)。

3. 臨床樣本檢測
EHFV感染樣本中,病毒RNA主要分布于腎小管上皮細胞及肺泡巨噬細胞胞質內,陽性信號率為92.3%(24/26),與血清學檢測結果一致;健康及DENV感染樣本均為陰性。

4. 技術穩定性
同一批樣本重復檢測3次,信號強度變異系數<5%,威尼德原位雜交儀的溫控精度(±0.2℃)保障了反應一致性。

討論

整合高特異性探針、優化的通透化方案及威尼德儀器的精準控制,顯著提升了RNA-ISH技術的靈敏度與可靠性。相較于傳統方法,該技術不僅能定量檢測病毒載量,還可揭示病毒在特定細胞類型中的動態分布,為解析EHFV致病機制提供了空間分辨率的分子證據。

威尼德紫外交聯儀的交聯參數優化,有效減少了組織RNA降解;而原位雜交儀的梯度控溫功能,確保了探針與靶標的穩定結合。此外,某試劑的低背景封閉液進一步降低了非特異性吸附,使弱信號得以清晰呈現。

結論

EHFV RNA原位雜交檢測技術,兼具高靈敏度、強特異性及操作重復性,可廣泛應用于病毒基礎研究、臨床病理診斷及抗病duyao物療效評估。威尼德系列儀器的性能優勢與某試劑的穩定品質,為技術推廣提供了堅實保障。未來將進一步優化多重標記方案,實現病毒與宿主因子的共定位分析。

參考文獻

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